Inspector jefe, "escoltado" por dos inspectores, uno para la parte operativa, y otro para la parte escuela, la que forma nuevos guias caninos. El jefe de la seccion se localiza en madrid, en Comisaria General, siendo Inspector Jefe. Comisario es ya el jefe de todas las unidades especiales, que tambien se localiza en la dehesa, en comisaria general, siendo este un Comisario Principal.
En las unidades perifericas, devido a que las forman pocos compañeros (creo que la mas grande son sevilla con quince compis y valencia con doce), estan dirigidas y coordinadas por un subis cada una, aunque siempre controladas desde madrid.