La fecha de efectos de toma de posesión es, según la resolución del CGM en cuestión, el 24 de octubre, así que legalmente ya has tomado posesión, aunque no te hayas dado cuenta, y solo falta el acto formal de firmar el PF correspondiente en tu destino. El día 23 o antes debes presentarte en tu nuevo destino y comunicar tu situación. Ya quedarás en una fecha para firmar PF´s, etc, pero tu toma de posesión se hará de oficio en cualquier caso. Los partes de bajas a partir de ya los debes hacer llegar allí y la solicitud de pasar la baja en el domicilio familiar debes remitirla a la División de Personal (así, en general) desde cualquier plantilla y ellos se encargarán de hacerlo llegar al despacho donde se tramitan las licencias pertinentes.
No deberías tener problema para todo ello. Supongo que la situación es agobiente por el mal momento en el que te ha ocurrido el percance, pero no te preocupes por nada, contacta con tu nueva plantilla y en el momento en que deban realizarse los trámites, los harás y seguirás con tu baja sin más problema hasta tu completa recuperación. Y la autorización para pasar la baja siempre se concede y sin demasiada demora, así que descuida. En principio, mientras se resuleve, deberías estar en tu nueva plantilla a partir del 23 de noviembre, pero si hablas con el jefe en cuestión o la secretaría, no creo que te pongan ninguna pega.
Recuperate bien, que es lo importante y feliz aterrizaje en tu nuevo destino y categoría.